1984年
  10月7日，李政道先生在北京正负电子对撞机奠基典礼上向邓小平同志建议：在中国设立博士后制度的同时设立博士后科学基金，将财政部一次性拨付的博士后专款存入中国国际信托投资公司等金融机构，以每年的存款利息或投资所得收益作为当年博士后科学基金的资助金额，并将此项基金叫做“邓小平博士后科学基金”。对此，小平同志表示：这种做法很好，我赞成，但不要以我的名字命名。  

  1985年
  7月，《国务院批转国家科委、教育部、中国科学院关于试办博士后科研流动站报告的通知》（国发〔1985〕88号）发布实施。文件明确：“设立博士后科学基金，主要用以鼓励和支持博士后研究人员中有科研潜力和杰出才能的年轻优秀人才”。

  1986年
  10月，全国博士后管理委员会召开第四次会议，讨论通过《国家博士后科学基金试行条例》（〔86〕国科发干字0802号）。

  1987年
  3月，全国博士后管理委员会召开第五次会议，讨论通过《博士后经费管理使用暂行规定》（〔87〕国科发干字0270号）。
  3月，经专家评审确定中国博士后科学基金第一批获得者。首批共资助博士后研究人员12名，资助金额11万元人民币和2.15万美元。

  1988年
  5月，全国博士后管理委员会印发《关于改进博士后科学基金评审办法的通知》（〔1988〕博管发字5号），规定从第4批博士后科学基金开始采取同行专家评议取代原来的专家组评审。

  1989年
  为加强博士后科学基金的评审、管理和使用，广开基金来源，便于同国内外各种基金组织进行交流合作，李政道先生建议成立中国博士后科学基金会。经中国人民银行批准，民政部登记注册，1990年5月成立中国博士后科学基金会，邓小平题写了会名，李政道先生题写贺词：“祝贺中国博士后基金会成立，为祖国的科学发展准备人才”。

  1990年
  5月，中国博士后科学基金会第一届理事会成立并召开第一届理事会会议。李政道先生任第一届理事会名誉理事长，沈克琦任理事长。会议通过了《中国博士后科学基金会章程》和《中国博士后科学基金筹资办法》。
  6月，中国博士后科学基金工作从全国博士后管委会划转中国博士后科学基金会。

  1993年
  6月，中国博士后科学基金会第二届理事会第一次会议通过《中国博士后科学基金资助条例》》（中博基〔1993〕9号）并颁布实施。
  11月，为表彰和奖励在科学、教育事业和经济建设中做出突出贡献的博士后研究人员，中国博士后科学基金会与北京格林沃德营养保健品有限公司共同设立“国氏”博士后奖励基金。截止1999年，共开展七批奖励工作，奖励优秀博士后研究人70名员。

  1996年
  11月，中国博士后科学基金会第三届理事会第一次会议讨论通过新的《中国博士后科学基金资助条例》（中博基〔1996〕5号）。

  1999年
  9月，人事部、全国博士后管理委员会颁布《中国优秀博士后奖励规定》（人发〔1999〕107号），决定设立“中国优秀博士后奖”，同时废止“国氏”博士后奖励基金。

  2002年
  12月，财政部决定以本金利息和国家财政拨款相结合的方式为博士后科学基金提供资助金。

  2006年
  9月，财政部印发《关于进一步推进博士后事业发展增加经费投入的函》（财行〔2006〕263号），决定从2006年起以国家财政拨款作为博士后科学基金资助金。
  9月，经财政部同意，博士后基金资助强度由一等3万、二等2万、三等1万调整为一等5万元，二等3万元，取消3等，并对基础性、原创性和公益性的研究给予适当倾斜。
  9月，经财政部批准，博士后科学基金设立特别资助，对在站期间取得重大自主创新研究成果和在研究能力方面表现突出的博士后进行奖励资助，资助金额10万元。
  国家审计署对博士后基金开展首次审计。审计结果认为：博士后科学基金管理的很好，也引起了社会极大关注，产生了良好的效益……在国家的各项基金中是很少见的。博士后科学基金资金量不算大，但发挥的社会、人才效益却很大。

  2007年
  3月，《中国博士后科学基金面上资助实施办法》（中博基字〔2007〕05号）颁布实施。

  2008年
  1月，中国博士后科学基金会第四届理事会第一次会议审议通过《中国博士后科学基金资助规定》（中博基字〔2008〕1号）并颁布实施。
  中国博士后科学基金开展第一批特别资助工作，共资助500名博士后研究人员。

  2011年
  中国博士后科学基金管理信息系统开通运行，博士后基金申报、评审工作实现信息化。

  2012年
  经财政部同意，博士后基金面上资助由一等5万元、二等3万元提高至一等8万元、二等资助金5万元，特别资助由10万元提高到15万元。
  4月，中国博士后科学基金会首次组织开展为期两年的博士后基金资助绩效评估工作。评估工作依托部级课题“中国博士后科学基金资助项目绩效评估研究”，确定了整体绩效评估和项目绩效评估方式，建立了相应的评估指标体系。评估工作对博士后基金设立以来的工作进行了客观评价，分析了成绩，指出了不足，为《中国博士后科学基金发展“十三五”规划》的制定及博士后绩效评估机制的建立奠定了基础。

  2013年
  财政部加大对中国博士后科学基金的投入力度，2013年基金总额4.3亿元，较2012年增长了0.8亿，当年资助总额相当于“十一五”期间基金经费的总额。
  为宣传、固化博士后研究人员优秀学术成果，中国博士后科学基金会试点开展博士后研究人员优秀学术专著出版资助工作。
  5月，中国博士后科学基金会第五届理事会第三次会议审议通过《中国博士后科学基金面上资助地区倾斜资助实施办法》，决定从2014年开始实施“西部地区博士后人才资助计划”。

  2014年
  6月，中国博士后科学基金会第五届理事会第四次会议通过《中国博士后科学基金特别资助实施办法》（中博基字〔2014〕16号），并颁布实施。

  2015年
  5月，中国博士后科学基金自第57批面上资助开始向申请人反馈专家评审结果。
  10月，为改革博士后基金资助模式，探索开展站前资助，加大吸引优秀博士进站做博士后。中国博士后科学基金会与中国科学院设立联合基金，开展支持“率先行动”联合资助优秀博士后项目。

      2016年

      1月，印发《全国博士后管委会办公室关于启用“在线预审、一次办结”博士后进出站服务平台的通知》（博管办〔2016〕3号），全面推进全国博士后服务窗口标准化规范化建设。

      3月，开通“中国博士后”微信公众号。

      7月，批准在广东省江门市试点建设全国博士后创新（江门）示范中心。

      2017年

      6月，全国博士后管委会办公室和德国亥姆霍兹联合会签署新的“中德博士后交流项目”协议书，协议合作期限5年，德方每年提供最多50个博士后岗位，岗位范围扩展到亥姆霍兹联合会下属全部18个研究中心。

      6月，根据《人力资源社会保障部 全国博士后管理委员会关于贯彻落实<国务院办公厅关于改革完善博士后制度的意见>有关问题的通知》（人社部发〔2017〕20号）要求，全国博士后进出站办公系统更新功能上线。

      8月，中国博士后科学基金会召开第六届理事会换届会议暨第一次理事会议：李政道先生任第六届理事会名誉理事长；国家自然科学基金委员会主任杨卫院士任第六届理事会理事长；中国科学院党组副书记、副院长（正部长级）刘伟平，中国社会科学院党组成员、副院长李培林，人力资源社会保障部留学人员和专家服务中心主任、党委副书记夏文峰任第六届理事会副理事长，其中夏文峰兼任秘书长。

      2018年

     10月，经过专家评审，人力资源社会保障部、全国博士后管理委员会批准399个单位设立博士后科研工作站。

     11月，中国博士后网站英文版正式开通。

     12月，全国博士后管委会办公室、中国博士后科学基金会首次开展博士后日常经费和中国博士后科学基金资助经费使用情况调查工作。

      2019年

      1月，启动实施中国博士后科学基金特别资助（站前）。中国博士后科学基金特别资助（站前）是为吸引新近毕业的国内外优秀博士进站，在前沿领域从事创新研究实施的资助，资助标准为18万元。

      1月，中国博士后科学基金会在北京市召开中国博士后科学基金会第六届理事会第五次、第六次会议。中国科学院院士，国家自然科学基金委员会主任、党组书记李静海当选中国博士后科学基金会理事长。

      4月，西安交通大学举行中国西部海外博士后创新示范中心成立大会。该示范中心于2018年10月18日由人力资源社会保障部批准成立。

      9月，人力资源社会保障部、全国博士后管理委员会印发《关于批准新设湖南大学哲学等339个博士后科研流动站的通知》（人社部发〔2019〕105号）。

      2020年

      2月，为积极有效应对新冠肺炎疫情，全国博士后进出站服务窗口快速发布《关于调整全国博士后进出站服务窗口业务办理方式的通知》的工作措施，采取“网上办、邮寄办、延期办”的措施，实现了博士后进出站工作安全、不中断。

     3月，印发《关于中国博士后科学基金向与新冠肺炎疫情防控有关的博士后研究人员开展专项资助的通知》，组织实施新冠肺炎疫情防控专项资助工作。共有593人申报，经过专家评审266人获得资助，资助金额4116万元。

      5月，印发《全国博士后管委会办公室关于开展博士后工作重要史料征集工作的通知》（博管办〔2020〕29号），在中国博士后制度实施35周年之际，就1985年以来与我国博士后事业发展相关的重要史料面向设站单位公开征集。

      11月，新版中国博士后网站和中国博士后网上办公系统上线，实现了博士后进出站备案、博士后国际交流计划、博士后工作综合评估等6项主要业务工作一网通办。

      12月，人力资源社会保障部、全国博士后管理委员会在北京召开中国博士后制度实施35周年座谈会。

      2021年

      3月，召开中国博士后科学基金会第六届理事会第九次会议，审议通过了《秘书长工作报告》《博士后基金2020年经费预算执行及2021年经费预算情况》《中国博士后科学基金会章程（修订稿）》。

      5月，人力资源社会保障部、全国博士后管理委员会印发《关于举办2021年全国博士后创新创业大赛的通知》（人社部函〔2021〕55号），启动第一届全国博士后创新创业大赛。12月，在广东省佛山市举办第一届全国博士后创新创业大赛总决赛。约1400个项目参赛，共产生57个金奖、91个银奖、125个铜奖。大赛期间，同步举办了博士后工作成果展示、全国博士后人才交流与科研成果转化对接等系列活动。

      11月，人力资源社会保障部、全国博士后管理委员会印发《关于进一步加强企业博士后科研工作站建设的通知》（人社部发〔2021〕88号）。